独立后，因受经济危机影响，科研经费严重短缺，农业科学技术出现了前所未有的萎缩状况。首先，科研人员锐减，科技潜力急剧下降。与1991年相比，1995年的科研人员减少了一半。在研究部门工作的研究人员大量流失，一部分回到俄罗斯，有的则流向西方国家。其次，资金严重短缺，严重影响农业科学技术的发展。由于科研机构的资金来源主要靠政府拨款，特别是对基础研究部门来说，拨款是唯一的资金来源，而国家资金十分紧缺，无力为研究与开发提供所需要的资金，因此，科研工作几乎无法正常开展，农业科学研究遭受的损失十分严重。